То, что сегодня известно о структуре и эволюции Тянь-Шаня, является результатом систематических исследований кыргызских, российских, казахстанских ученых и ученых других зарубежных стран. В последние годы исследованием данного региона наряду с Республиками Центральной Азии и Россией занимаются ученые США, Германии, Франции, Бельгии, Китая и других стран, представляющие различные научно-исследовательские организации. Примером эффективного научного сотрудничества явилось выполнение международного мультидисциплинарного проекта "Геодинамика Тянь-Шаня". К настоящему времени Научная станция имеет самые тесные научно-технические контакты и проводит совместные исследования со следующими организациями:

• Институт геологии Национальной академии наук Кыргызской Республики
• Институт сейсмологии Национальной академии наук Кыргызской Республики
• Институт физики и механики горных пород НАН Кыргызской Республики
• Кыргызско-Российский Славянский университет имени Б.Н. Ельцина
• Кыргызский национальный университет им. Ж. Баласагына
• Американский университет в Центральной Азии
• Агентство по геологии при Правительстве Кыргызской Республики
• Геологический институт Российской академии наук
• Институт океанологии Российской академии наук
• Московский государственный университет
• Объединенный институт высоких температур Российской академии наук
• Объединенный Институт геологии, геофизики и минерального сырья Сибирского отделения Российской академии наук
• Сейсмологическое бюро СУАР, Китай
• Институт геоэкологии Российской академии наук
• Объединенный институт физики Земли им.О.Ю.Шмидта Российской академии наук
• Институт сейсмологии МОНиК Республики Казахстан
• Институт геофизики национального ядерного центра республики Казахстан
• Национальный университет Узбекистана им. Улугбека
• Институт сейсмологии Узбекистана
• НПК "Прогноз" Казселезащита, Агенство по чрезвычайным ситуациям республики Казахстан
• Университет штата Орегон, США
• Индианский университет, США
• Массачусеттский технологический институт, США
• Центральный Вашингтонский университет, США
• Институт планетарной геофизики и океанографии Калифорнийского университета в Сан Диего, США
• Калифорнийский университет в Риверсайде, США
• Мюнхенский университет, Германия
• Потсдамский университет, Германия
• Компания "Phoenix Geophysics", Канада
• Государственный университет Сан-Диего, США
• Калифорнийский университет Сан-Диего, США
• Корпорация сейсмологов университетов США (IRIS)